Согласно пункту 3 статьи 346.16 НК РФ, если упрощенец продает основное средство до истечения трех лет с момента его покупки, он должен скорректировать свою налоговую базу за весь период пользования им. В частности, учесть расходы не в полной сумме, а лишь в сумме амортизации, рассчитанной по нормам главы 25 НК РФ. При сроке полезного использования более 15 лет критичным является срок, равный 10 годам.

Если компания не сделала такую корректировку, налоговики при проверке обычно снимают все расходы по проданному основному средству и доначисляют единый налог. Но есть возможность избежать хотя бы части потерь в такой ситуации.

По мнению чиновников, если налогоплательщик сам не заявил о праве учесть расходы на амортизацию, то в ходе проведения проверки они не могут быть учтены. Делать перерасчет не входит в обязанности налогового органа.

Однако Президиум ВАС РФ пришел к выводу, что такие действия неправомерны. Даже если налогоплательщик не рассчитал сумму амортизации самостоятельно, то такую процедуру должны выполнить инспекторы. Судьи решили, что обязанность сделать корректировку относится как к самой компании, так и к налоговикам ( постановление от 29.06.10 № 808/10 ).

Кроме того, некоторые суды считают, что упрощенец вправе применить положения подпункт а 1 пункта 1 статьи 268 НК РФ и уменьшить доходы от реализации основного средства на его остаточную стоимость (постановления федеральных арбитражных судов Восточно-Сибирского от 31.03.09 № А74-2378/08-Ф02-1138/09 , Уральского от 22.08.12 № Ф09-7690/12 , Дальневосточного от 19.06.08 № Ф03-А80/08-2/1669 (оставлено в силе определением ВАС РФ от 27.10.08 № 13621/08 ) округов)).

Источник: постановление Президиума ВАС РФ от 29.06.10 № 808/10