Компания, которая потеряла право на применение упрощенки, обязана уплатить НДС в бюджет с суммы реализации с момента потери права. Сумму этого налога можно учесть в составе налоговых расходов ( определение ВАС РФ от 15.04.10 № ВАС-4125/10 ). Это позволит компании сэкономить порядка 20 процентов (уменьшение налога на прибыль) от уплаченной в бюджет суммы сверх возможности получить вычет по входному НДС ( п. 6 ст. 346.25 НК РФ ).

Несмотря на то что чиновники выступают против этого ( письмо Минфина России от 07.06.08 № 03-07-11/222 ), на сторону налогоплательщиков встал ВАС РФ, который уточнил, что Налоговый кодекс позволяет учесть в расходах те налоги, которые не были предъявлены покупателю ( п. 1 ст. 264 и п. 19 ст. 270 НК РФ). А НДС, уплаченный в бюджет в связи с потерей права на применение спецрежима, как раз и не предъявляется покупателям. Аналогичного мнения придерживаются и суды ( постановление Федерального арбитражного суда Северо-Кавказского округа от 13.08.10 № А32-2525/2009-70/36 ).

Кроме того, против предъявления налога покупателям в этой ситуации выступают и сами фискалы. Так, в соответствии с письмом ФНС России от 08.02.07 № ММ-6-03/95@ организация, потерявшая право на применение УСН, не вправе выставить счет-фактуру задним числом своему контрагенту.

Источник: Определение ВАС РФ от 15.04.10 № ВАС-4125/10