Налогоплательщик, который приобретает товары для операций, не облагаемых НДС, вправе в любой момент отказаться от освобождения НДС и применить налоговые вычеты. Причем сделать это можно и задним числом.

Напомним, что при осуществлении не облагаемых НДС операций общество должно выставлять счета-фактуры без выделения налога ( п. 5 ст. 168 НК РФ ). Вместе с тем пункт 5 статьи 173 НК РФ допускает в таких случаях выставлять покупателю счета-фактуры с НДС и уплачивать этот налог в бюджет. Таким образом, в течение какого-то периода времени компания может части своих покупателей выставлять счета-фактуры с НДС, а части – без. И пересчитать, что выгоднее – оставаться весь период неплательщиком НДС или отказаться от льготы.

Формально отказаться нужно не позднее 1-го числа налогового периода, когда общество не планирует применять льготу ( п. 5 ст. 149 НК РФ ). При этом общество не обязано ждать от налоговиков ответных документов. В таком случае даже пропуск срока подачи заявления об отказе от льготы по вычетам этому не помеха ( постановление Федерального арбитражного суда Восточно-Сибирского округа от 31.08.11 № А33-17561/2010 ).

Конечно, по мнению ФНС России, при нарушении срока подачи заявления не применять освобождение можно будет только со следующего периода. При этом, несмотря на то что НДС в силу пункта 5 статьи 173 НК РФ перечисляется в бюджет, у компании отсутствует право на вычет ( письмо от 26.08.10 № ШС-37-3/10064 ). Однако судьи не разделяют такой подход и считают применение вычетов правомерным (постановления федеральных арбитражных судов Дальневосточного от 06.08.12 № Ф03-3426/2012 , Восточно-Сибирского от 16.11.11 № А33-16640/2010 округов).

Источник: постановление Федерального арбитражного суда Восточно-Сибирского округа от 31.08.11 № А33-17561/2010